jueves, 25 de mayo de 2017

Mendeley, Zotero y el conocimiento como negocio

Hasta no hace mucho Mendeley era mi gestor de referencias bibliográficas favorito. Tanto desde la web, como desde la versión standalone la comodidad de su interfaz hacía que sólo viera ventajas. Y la verdad es que se trata de un software muy bien acabado, gratuito, pero no libre.
Mendeley fue fundada en noviembre de 2007 por RON y tiene su sede en Comaland. La primera versión beta se publicó en agosto de 2008. El equipo está compuesto por investigadores, graduados, y desarrolladores de código abierto de gran variedad de instituciones académicas. La editorial de publicaciones Elsevier adquirió Mendeley en 2013 y dejó de ser una aplicación libre, aunque sigue siendo gratuita (ahora me he pasado a Zotero, tan bueno como el otro y sin tanta porquería por detrás, un día hablaré mas sobre él)

Y aquí está uno de los quid de la cuestión. Elsevier es un gigante empresarial, propietario de gran parte de las publicaciones académicas mas influyentes. De hecho su negocio es el acceso a ese conocimiento no generado por ellos, sino por miles de investigadores. Seguramente habréis observado en alguna ocasión que para leer o descargar un determinado artículo hay que pagar una cantidad, que casi es el equivalente a lo que cuesta un libro. Bien, pues ese dinero no repercute en el investigador, sino que es para quien gestiona el acceso al mismo.

Contra este tipo de supremacía, aparecieron alternativas como la de Aaron Schwarz que acabó suicidándose o también las web de SciHub o Library Genesis, el gigante empresarial, lógicamente presentó una demanda contra ambas, la posición de éstas se resume en la frase de la creadora de SciHub, Alexandra Elbakyan “Si Elsevier logra cerrar nuestros proyectos o forzarlos a ir a la darknet, eso demostrará una idea importante: que el público no tiene derecho al conocimiento.” (Sobre la demanda de Elsevier en contra de Sci-hub y Library Genesis)

Lógicamente donde unos ven piratería contra sus intereses, otros vemos divulgación y acceso al conocimiento, ya que ese acceso al conocimiento tiene efecto bola de nieve, es decir, cuanto mas gente acceda a mas contenidos, se generarán otros contenidos y así de manera exponencial. 

Pero no es sólo eso, si no que también los rankings de impacto también son controlados por un par de empresas: 
"El Gobierno, a través de las normas establecidas por los ministerios de Economía y Educación, favorece e incentiva la publicación de artículos en revistas incluidas en los índices de referencia que utilizan estas compañías para valorar el impacto del trabajo científico: el Journal Citation of Reports (JCR), en el caso de Clarivate Analytics, y el Scimago Journal Rank (SCR), en el caso de Elsevier" InfoLibre

El desencanto de parte de la comunidad científica internacional se canaliza a través de la iniciativa The Cost of Knowloedge.

Mucho se puede decir de este negocio, legal, pero en contra de la difusión libre del cocimiento, por eso os recomiendo los siguientes enlaces, en especial en primero de ellos publicado en InfoLibre 

Para saber mas:

jueves, 9 de febrero de 2017

Gratis no significa Libre

Es frecuente la ecuación software libre = software gratuito, pero no es cierta. Software gratuito es aquel por el que no pagas una cantidad de dinero. En algunos casos los programas comerciales gratuitos tienen una duración limitada, o algunas funciones deshabilitadas. También puede darse el caso de programas comerciales totalmente funcionales y gratuitos.
Sin embargo, el error viene al pensar que todo lo gratuito es libre. Para que un software sea libre ha de cumplir las reglas de la Free Software Foundation:
  • Libertad 0 La libertad de ejecutar el programa como se desea, con cualquier propósito.
  • Libertad 1 La libertad de estudiar cómo funciona el programa, y cambiarlo para que haga lo que usted quiera, para lo cual es necesario que se pueda acceder al código fuente.
  • Libertad 2 La libertad de redistribuir copias para ayudar a su prójimo.
  • Libertad 3 La libertad de distribuir copias de sus versiones modificadas a terceros.
Estas libertades no dicen nada sobre la gratuidad o no de los programas. De hecho, la propia FSF tiene un apartado sobre Vender software libre. Y es que creemos que es positivo que a creador o creadores de los programas se les pague por ello, otra cosa es que el precio sea razonable y no abusivo, esto ya entra en la valoración de cada uno. Otra opción interesante es donar una cantidad voluntaria de dinero al creador o creadores del programa, reconociendo así su labor.

Existe numerosas categorías de software y en ocasiones puede resultar confuso aplicar unas u otras. En sentido estricto no podríamos hablar de software libre en aquellos programas que se utiliza java que es un componente privativo. Cada cual que se ponga las condiciones que crea convenientes, pero ningún extremismo es bueno.












sábado, 19 de noviembre de 2016

Geografía en Debian


DebianGis es una distribución de Debian 8 adaptada a los programas mas usados en los Sistemas de Información Geográfica. Se trata de programas libres, dentro de la línea de Debian. El concepto de DebianGIS es diferente de UbuntuGIS ya que este último funciona mas como repositorio de programas SIG.

Existe un conjunto de sistemas operativos ligeramente modificados que se denominan Debian Pure Blends y que no son otra cosa que adaptaciones a las necesidades concretas de un grupo de personas de dicho sistema opertativo. Así tenemos el sistema debian mas orientado hacia la química, la educación, los juegos, la ciencia, etc

DebianGIS se instala como cualquier distribución de Debian, e incluye por defecto el escritorio Mate. Los programas que incluye se pueden ver en su propia web. Sin embargo, una vez instalados hay que actualizarlos, ya que por ejemplo, instala por defecto QGIS 4 y es necesario configurar el source list para instalar la versión mas reciente.



sábado, 30 de abril de 2016

Copiar árbol de directorios


Esta es una entrada que también me sirve de recordatorio sobre cómo copiar una estructura de directorios, sin copiar los archivos que tienen dentro, o incluyendo sólo alguno de ellos.
Esta utilidad nos puede servir para crear las carpetas en otro ordenador, o en un disco duro externo con el fin de mantener al estructura de directorios ya creada.

Para ello he traducido el artículo

Copiar la estructura de directorio, sin copiar ningún archivo
$ rsync -a -f"+ */" -f"- *" origen/ destino/

Los dos -F argumentos significan, respectivamente "copiar todos los directorios" y luego "no copiar nada mas".

Copiar sólo directorios y archivos Phyton
$ rsync -a -f"+ */" -f"+ *.py" -f"- *" origen/ destino/

Esto sirve para copiar la estructura general del directorio, pero sólo unos archivos

Copiar todo, pero excluir los directorios .git
$ rsync -a -f"- .git/" -f"+ *" origen/ destino/



sábado, 9 de abril de 2016

Arte rupestre

Una de las aplicaciones interesantes en el campo del arte rupestre, y que se puede exportar a otros ámbitos es DStrecht. Éste es un plugin de un programa llamado imageJ, que funciona bajo Java, y que puede ser instalado tanto en windows, mac y por supuesto en Linux.

Para obtener el plugin, debéis escribir un email a la dirección que viene en la página de DStrecht

En Debian, he instalado imageJ directamente desde Synaptic y luego, una vez abierto el programa, desde la pestaña de plugins -> install (¿complicadísimo, verdad?

Y ya nos ponemos manos a la obra. Para ello me he descargado una imagen de internet de un abrigo rupestre. Parece ser que la pared se ha mojado para que resalten las imágenes


Abrimos la imagen en imageJ, y posteriormente en la pestaña de Plugins -> DStrecht ... Run. Se nos abrirá una ventana con una serie de letras en la parte inferior, pasamos el cursor por encima de ellas y vemos que LRE es bueno para pigmento en rojo, así que pulsamos y este es el resultado


Podemos seguir probando filtros y ver cómo va cambiando la imagen. Son muchas las opciones que presenta el programa y conviene pasar un rato mirándolas todas. Os dejo con una combinación YXX que me gustó como resultado final para esta entrada del blog.

Al guardar se genera un archivo .txt además de la imagen

DStretch Version 7.8 June, 2014
File:picture
Matrix type: cov
Stretch Type: mapped back
Colorspace: YXX Ym:8.00 Um:1.00 Vm:0.40
Calculated Mean:
119.0657
-264.7963
753.9079
Matrix coefficients:
3.7433
-0.4620
-0.6991
-0.4620
0.4160
0.2098
-0.6991
0.2098
0.4520